Skip to content
akaturk Academic measurement
Sign in Sign up

Academician

ŞERİFE ESRA ERDAL BAĞRIYANIK

Profesör

Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Temel Tıp Bilimleri Bölümü

Research topics OpenAlex
  1. Ana Dal Sağlık Bilimleri Temel Alanı
  2. Yan Dal Tıbbi Biyoloji
Articles 41 YÖKSİS 41 · OpenAlex 0 Total citations 2,020 h-index 23 · OpenAlex OpenAlex coverage %71 matched 29 / 41 Q1 articles 17 Scopus · WoS Q1 10 Best field rank #7,469 / 39,749 Main field · top 18.8% Co-authors 167 20 Turkish institutions

Citation impact

Citation counts of the articles matched in OpenAlex, citing publications from Crossref and the Stanford/Elsevier list. Sources are shown separately and never added up.

OpenAlex YÖKSİS articles matched in OpenAlex: 29 + YÖKSİS · co-author record: 20
h-index 23 Percentile in Türkiye: 92 #201 of 2,152 at their university by h-index
i10-index
35
Total citations
2,020
Top 5.5% in Türkiye
Per article
41.2
FWCI
1.86
1.00 = world average
World top 1%
0
World top 10%
13

Most cited articles

  1. Canonical Wnt signaling is antagonized by noncanonical Wnt5a in hepatocellular carcinoma cells 2009 world top 10% 226 citations
  2. Robust, long-term culture of endoderm-derived hepatic organoids for disease modeling. 2019 world top 10% 158 citations
  3. Elevated hepatocyte growth factor expression as an autocrine c Met activation mechanism in acquired resistance to sorafenib in hepatocellular carcinoma cells 2016 world top 10% 136 citations
How is this computed?

h-index and citations are computed from the citation counts of this academic’s YÖKSİS articles matched in OpenAlex (not Google Scholar, WoS or Scopus). Unmatched articles are not included. 20 articles (1,105 citations) tagged with this academic’s YÖK author id in co-authors’ YÖKSİS records count only towards citations, h-index and i10; article counts, percentiles and rankings use their own YÖKSİS list.

Field ranking

Position in the main-field, side-field and keyword cohorts by YÖKSİS article score; each card opens that ranking.

YÖKSİS ?

Works 41

YÖKSİS and OpenAlex records: index distribution, journals published in, a filterable article list and the other output types.

Indexes and citation percentiles

?
TR Index 3 articles
OpenAlex citation percentile
Top 1%0
Top 10%7
Avg · n 31 %69.6
Other counts

Scopus (SJR)

  • Excluding abstracts 29 Q1 16 Q2 10 Q3 2 Q4 1
  • YÖKSİS rows 32

WoS (JCR)

  • Excluding abstracts 29 Q1 9 Q2 8 Q3 9 Q4 3
  • YÖKSİS rows 32

Articles

Articles with YÖKSİS and OpenAlex source split; narrow by quartile or TR Index.

41articles

Journals with publications

25 journals

Narrow down

Scopus (SJR)
Q117 Q210 Q32 Q41
WoS (JCR)
Q110 Q28 Q39 Q43
TR Index
3articles

Article list

  1. 2025 Modeling hepatic fibrosis in TP53 knockout iPSC-derived human liver organoids Molecular Oncology DOI 10.1002/1878-0261.70119 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 78.8%
  2. 2025 Generation of Functional Endodermal Hepatic Organoids Journal of Visualized Experiments DOI 10.3791/65027 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q3 OpenAlex 61.6%
  3. 2025 A BAG-1-inhibitory peptide, GO-Pep, suppresses c-Raf activity in cancer. Communications biology DOI 10.1038/s42003-024-07419-4 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 2.0%
  4. 2024 Natural products to enhance anti-tumor effects of trastuzumab and paclitaxel on the SKBR3, which is human breast cancer cell line Journal of Clinical Oncology YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1
  5. 2024 Imaging of Isolated Exosomes by Correlative Microscopy Journal of Histochemistry & Cytochemistry DOI 10.1369/00221554241233346 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q4 OpenAlex 70.4%
  6. 2023 Human Liver Organoid Models for Assessment of Drug Toxicity at the Preclinical Stage Endocrine Metabolic & Immune Disorders – Drug Targets DOI 10.2174/1871530323666230411100121 YÖKSİS SJR Q3 JCR Q3 OpenAlex 84.9%
  7. 2023 EGFR and Lyn inhibition augments regorafenib induced cell death in sorafenib resistant 3D tumor spheroid model Cellular Signalling DOI 10.1016/j.cellsig.2023.110608 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q2 OpenAlex 76.7%
  8. 2023 Spatio-temporal dynamics enhance cellular diversity, neuronal function and further maturation of human cerebral organoids Communications Biology DOI 10.1038/s42003-023-04547-1 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex top 10% OpenAlex 97.2%
  9. 2022 VARS1 Mutations Associated with Neurodevelopmental Disorder Are Located on A Short Amino Acid Stretch of The Anticodon-Binding Domain The Scientific and Technological Research Council of Turkey (TUBITAK-ULAKBIM) - DIGITAL COMMONS JOURNALS DOI 10.55730/1300-0152.2631 YÖKSİS TR Index SJR Q2 JCR Q3 OpenAlex 54.7%
  10. 2021 LGR5/R-Spo1/Wnt3a axis promotes stemness and aggressive phenotype in hepatoblast-like hepatocellular carcinoma cell lines Cellular Signalling DOI 10.1016/j.cellsig.2021.109972 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q2 OpenAlex 75.8%
  11. 2021 Changes in Wnt and TGF-β Signaling Mediate the Development of Regorafenib Resistance in Hepatocellular Carcinoma Cell Line HuH7 Frontiers in Cell and Developmental Biology DOI 10.3389/fcell.2021.639779 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex top 10% OpenAlex 95.3%
  12. 2021 Regulation of Wnt Signaling Pathways at the Plasma Membrane and Their Misregulation in Cancer Frontiers in Cell and Developmental Biology DOI 10.3389/fcell.2021.631623 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex top 10% OpenAlex 96.8%
  13. 2021 Three-Dimensional Cell Culture Models of Hepatocellular Carcinoma \u2014 a Review Journal of Gastrointestinal Cancer DOI 10.1007/s12029-021-00772-1 YÖKSİS SJR Q3 JCR Q4 OpenAlex 67.0%
  14. 2021 Doxorubicin\u2010induced senescence promotes stemness and tumorigenicity in EpCAM−/CD133− nonstem cell population in hepatocellular carcinoma cell line, HuH\u20107 Molecular Oncology DOI 10.1002/1878-0261.12916 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex top 10% OpenAlex 98.3%
  15. 2021 Transcriptome Dynamics of Human Neuronal Differentiation From iPSC Frontiers in Cell and Developmental Biology DOI 10.3389/fcell.2021.727747 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 60.6%
  16. 2020 A Novel Function for KLF4 in Modulating the De-Differentiation of EpCAM(-)/CD133(-) nonStem Cells into EpCAM()/CD133() Liver Cancer Stem Cells in HCC Cell Line HuH7 CELLS DOI 10.3390/cells9051198 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex top 10% OpenAlex 92.1%
  17. 2019 Antiproliferative activity of (R)-4 ’xx-methylklavuzon on hepatocellular carcinoma cells and EpCAM()/CD133() cancer stem cells via SIRT1 and Exportin-1 (CRM1) inhibition EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY DOI 10.1016/j.ejmech.2019.07.024 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 80.4%
  18. 2019 Robust, long-term culture of endoderm-derived hepatic organoids for disease modeling. Stem Cell Reports YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex top 10% OpenAlex 97.5%
  19. 2018 Nanofibrous gelatine scaffolds integrated with nerve growth factor-loaded alginate microspheres for brain tissue engineering Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine DOI 10.1002/term.2353 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q2 OpenAlex 76.2%
  20. 2018 Adipokine levels and perilipin gene polymorphisms in obese Turkish adolescents with non-alcoholic fatty liver disease Erciyes Tıp Dergisi/Erciyes Medical Journal DOI 10.5152/etd.2018.0010 YÖKSİS TR Index SJR Q4 JCR Q3 OpenAlex 3.8%

Projects 14 See all (14) →

  1. 2023 HCC gelişiminde EpCAM+ kanser kök hücrelerinin epigenetik regülasyonunda rol oynayan EZH2 aracılıklı H3K27me3 hedefi olan genlerin belirlenmesi - Tüseb A GRUBU ACİL AR-GE PROJELERİ · Tamamlandı 2023-01-24 – 2024-11-08
  2. 2021 Tümöroid bazlı ilaç taraması için yerli (in-house) yüksek verimli görüntüleme platformunun geliştirilmesi Diğer (Ulusal) · Tamamlandı 2021-08-01 – 2023-02-01
  3. 2019 İn vitro üç boyutlu serebral organoid kültür temelli çip-üstü-Rett sendromu modelinin geliştirilmesi -Tübitak 1001 · Tamamlandı 2019-11-01 – 2023-02-09
  4. 2019 Regorafenibin Moleküler Etkisinin Sorafenib Dirençli Hücreler ile kurulam cok Hücreli 3D Tümör Sferoidlerinde Araştırılması Özel Kuruluşlar · Tamamlandı 2019-12-10 – 2021-05-10
  5. 2018 Karaciğer Knaserinin Modellenmesinde İndüklenebilir Pluripotent Kök Hücre (iPSC) Kaynaklı Hepatik Organoidler -Tübitak 1001 · Tamamlandı 2018-02-19 – 2022-01-27

Proceedings 82 See all (82) →

  1. — xxx International Conference on Prescriptomics and Precision Medicine
  2. 2019 Modeling liver disorders using 3D organoids BIOMED 2019
  3. — Differential outcomes of experimental hypoxia conditions on cancer cell behaviours in HCC FEBS Congress
  4. 2019 Karaciğer kanseri ilaç dirençliliğinde mikroçevreyi taklit eden 3 boyutlu sferoid modelinin geliştirilmesi Onkolojide İz Bırakanlar Zirvesi
  5. 2016 TXNIP overexpression promotes aggressive phenotype in HCC cell lines 41th FEBS Congress

← Back to academicians

Collaboration network

From the author lists of YÖKSİS publication records. Duplicate records of a work count once; institutions are co-authors’ current YÖKSİS affiliations.

Co-authors
167
With an akaturk profile
56
Turkish institutions
20
Co-authored works
%100

Academic co-authors 56

  1. SAFİYE NEŞE ATABEY Profesör · İzmir Tınaztepe Üniversitesi 16
  2. ZEYNEP FIRTINA KARAGONLAR Profesör · İzmir Ekonomi Üniversitesi 8
  3. ŞERİF ŞENTÜRK Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 5
  4. DENİZ NART Profesör · Ege Üniversitesi 4
  5. EVİN İŞCAN Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 4
  6. FUNDA YILMAZ BARBET Profesör · Ege Üniversitesi 4
  7. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN Profesör · İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 4
  8. MEHMET ÖZTÜRK Profesör · İzmir Tınaztepe Üniversitesi 4
  9. NUR ARSLAN Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 4
  10. NURİ ÖZTÜRK Profesör · Gebze Teknik Üniversitesi 4
Show all (56)
  1. ÖZGÜL SAĞOL Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 4
  2. GÖKHAN KARAKÜLAH Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 3
  3. HÜSNÜ ALPER BAĞRIYANIK Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 3
  4. MUKADDES GÜMÜŞTEKİN Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 3
  5. NEVİN ERSOY Doktor Öğretim Üyesi · İzmir Tınaztepe Üniversitesi 3
  6. KAMİL CAN AKÇALI Profesör · Ankara Üniversitesi 2
  7. MUSTAFA YILMAZ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 2
  8. OYA SAYIN Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 2
  9. TEVFİK TAMER ÖNDER Profesör · Koç Üniversitesi 2
  10. TUNCAY KÜME Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 2
  11. AHMET BURSALI Profesör · Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi 1
  12. ALP CAN Profesör · Ankara Üniversitesi 1
  13. ASLI TOYLU Doktor Öğretim Üyesi · Akdeniz Üniversitesi 1
  14. ATHANASIA PAVLOPOULOU Doktor Öğretim Üyesi · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1
  15. AYŞE SEMRA HIZ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1
  16. BALA GÜR DEDEOĞLU Profesör · Ankara Üniversitesi 1
  17. BUKET KOSOVA Profesör · Ege Üniversitesi 1
  18. BURCU YALDIZ Öğretim Görevlisi (ders Vermekle Görevli) · Adana Alparslan Türkeş Bilim Ve Teknoloji Üniversitesi 1
  19. EREN ŞAHİNER Profesör · Ankara Üniversitesi 1
  20. EZGİ KARACA EREK Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1
  21. GÜLÇİN ÇAKAN AKDOĞAN Doktor Öğretim Üyesi · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1
  22. GİZEM DİNLER DOĞANAY Profesör · İstanbul Teknik Üniversitesi 1
  23. HAKKI GÖKHAN İLK Profesör · Ted Üniversitesi 1
  24. HANİ ALOTAİBİ Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1
  25. HİLAL ÖZDAĞ SEVGİLİ Profesör · Ankara Üniversitesi 1
  26. IŞIK YULUĞ Doçent · İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi 1
  27. KEMAL ERGİN Profesör · Aydın Adnan Menderes Üniversitesi 1
  28. MEHMET BATU ERMAN Profesör · Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi 1
  29. MEHMET ÖZTÜRK Profesör · Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi 1
  30. MELTEM KURUŞ Profesör · İzmir Katip Çelebi Üniversitesi 1
  31. METİNER TOSUN Profesör · İzmir Ekonomi Üniversitesi 1
  32. MUSTAFA TEKİN Doktor Öğretim Üyesi · Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi 1
  33. SACİDE ALTINKAYA Profesör · İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 1
  34. SEVAL KILIÇ Doktor Öğretim Üyesi · İstanbul Medeniyet Üniversitesi 1
  35. TAMER YAĞCI Profesör · Gebze Teknik Üniversitesi 1
  36. TUĞBA YAVUZŞEN Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1
  37. ULUÇ YİŞ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1
  38. YASEMİN ERAÇ Profesör · Ege Üniversitesi 1
  39. ÇIĞIR BİRAY AVCI Profesör · Ege Üniversitesi 1
  40. ÖZDEN YALÇIN ÖZUYSAL Profesör · İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 1
  41. ÖZGE CAN Profesör · Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi 1
  42. ÖZGE TATLI Doktor Öğretim Üyesi · İstanbul Medeniyet Üniversitesi 1
  43. ÖZLEM YEŞİL ÇELİKTAŞ Profesör · Ege Üniversitesi 1
  44. ÖZLEM İLK Profesör · Orta Doğu Teknik Üniversitesi 1
  45. ÖZLEN KONU KARAKAYALI Profesör · İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi 1
  46. ŞEYDA DEMİR YÜKSEL Araştırma Görevlisi · Dokuz Eylül Üniversitesi same university 1

National collaboration 20 institutions

Within own university23 joint works · Dokuz Eylül Üniversitesi

  1. İzmir Tınaztepe Üniversitesi 21 works · 3 academics
  2. İzmir Ekonomi Üniversitesi 9 works · 2 academics
  3. Ege Üniversitesi 6 works · 6 academics
  4. İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 6 works · 3 academics
  5. Ankara Üniversitesi 5 works · 5 academics
  6. Gebze Teknik Üniversitesi 4 works · 2 academics
  7. Koç Üniversitesi 2 works · 1 academics
  8. İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi 2 works · 2 academics
  9. İstanbul Medeniyet Üniversitesi 2 works · 2 academics
  10. Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi 1 works · 2 academics
Show all (20)
  1. Adana Alparslan Türkeş Bilim Ve Teknoloji Üniversitesi 1 works · 1 academics
  2. Akdeniz Üniversitesi 1 works · 1 academics
  3. Aydın Adnan Menderes Üniversitesi 1 works · 1 academics
  4. Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi 1 works · 1 academics
  5. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi 1 works · 1 academics
  6. Orta Doğu Teknik Üniversitesi 1 works · 1 academics
  7. Ted Üniversitesi 1 works · 1 academics
  8. Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi 1 works · 1 academics
  9. İstanbul Teknik Üniversitesi 1 works · 1 academics
  10. İzmir Katip Çelebi Üniversitesi 1 works · 1 academics

Other co-authors (incl. international) 111

Soheil Akbari 10Mustafa Karabiçici 6Peyda Korhan 4Sanem Tercan-Avcı 4Sedat Karademir 4AYŞİM GÜNEŞ 3Murat Çokaklı 3Yağmur Azbazdar 3İMGE KUNTER 3Ayça Arslan Ergül 2DOĞUKAN KOÇ 2Ece Sarıyer 2Emine KANDEMİŞ 2Ezgi Bağırsakçı 2Haluk Yüzügüllü 2Kübra Nur Kaplan 2RENGÜL ATALAY 2YAVUZ TOKGÖZ 2YELİZ YILMAZ 2brian carr 2eren şahin 2ADİLE ÖZGÖRENAli CagirAlp Ertunga EyupoğluArda KıpçakAybike ErdoğanAycan SezanAykut ÜrenAyşim GözükızılB ŞengünBARIŞ ERDURBERNA BIÇAKÇIBakiye GökerBaran DingiloğluBenhaj KhemaisBetül Zehra TemurBilge KaraçiçekBiter BilenBurcu OzcimenCanan Çelikel

Show all (111)

Canan ÇelikerCeren BarutçuoğluCeyda ÇalışkanChristopher KorchD SunayDilsa MizrakDirk MoserDonald BottaraDoğa EskierE ÖzelEcenur CebiEkşioğlu Demiralp EmelEmine ÇelikEray EnustunEvin ÖzenEzgi BaştürkFİKRİ MERT ALTINAYGG SevinçGiray BozkayaGÜNEY BADEMCİGökhan YıldızGözde BecerenGürsoy Yüzügüllü ÖzgeHakan BozkayaI AyvazIsmail AkcokJudith SchmitzK SevinçKadriye GüvenLeman BinokayMERVE KESKİNKILIÇMURAT ÖZGÖRENMUSTAFA CENGİZ YAKICIERMelda BüyüközMesut TezMine MumcuoğluMurat DelmanMurat KılıçMİRAY TÜRKERNejat AkarNilgün TaşdemirO BaşakOnur GüntürkünPelin Sağlam-MetinerRobert KumstaSEMİHA TERLEMEZSebastian OcklenburgSena AlptekinSena YanaşıkSevgi BağışlarSude Mısra BaylanSıla SezanTolga ÇağatayTopel HandeTugce KanburTuğsan BallıTülay CANDATülay KarakulakUtku DevamogluYagmur FilizYücel Burcu Özdenkıvılcım Eren Ateşumut aykutluvito guerraÇİĞDEM ERESEN YAZICIOĞLUÇİĞDEM SELLİÇİĞDEM ÖZENÖZDEN ÖZÖzge Ertemözüm karpatİshak Abdurrahman Işık

Authors without an akaturk profile (international researchers, retired or former academics, students, clinicians) are grouped by name spelling; short forms such as “Gulluce M.” join the single full name they match.