Erkek Üreme Sisteminde SARS-CoV-2 RNA’sını Hedefleyen miRNA’ların ve Potansiyel Hedef Genlerinin İn Silico Olarak Belirlenmesi

OpenAlex Türkçe

Amaç: Dünya genelinde milyonlarca mortalite ve morbiditeye neden olan SARS-CoV-2 enfeksiyonu insanlarda moleküler düzeyde çok sayıda farklı patolojiye sebep olmuştur. Yapılan çalışmalar bu virüsün erkek üreme hücreleri üzerine etkili olabileceğini göstermiştir. Bu çalışmada, SARS-CoV-2 enfeksiyonunun miRNA’lar aracılığı ile infertiliteye nasıl sebep olabileceğinin in silico araştırılması amaçlandı. Gereç ve Yöntemler: Sağlıklı testis dokusunda en yüksek oranda ifade edilen miRNA’lar Tissue Atlas'tan elde edildi. Bu miRNA’lar arasından COVID-19 RNA’sını hedeflediği belirlenen miRNA’lar miRDB veri tabanından listelendi. Elde edilen liste makine öğrenimi algoritmasını kullanan miRWalk veri tabanı ile karşılaştırıldı. Ortak hedefler deneysel olarak doğrulanmış miRNA-hedef etkileşimleri veri tabanı olan miRTarBase ve sonrasında TargetScan ile eşleştirildi. Bulgular: COVID-19 RNA dizisini hedefleyen ve in silico olarak endojen seviyelerinin etkilendiği tespit edilen testis dokusuna özgü miRNA’lar belirlendi. Bunlardan hsa-miR-195-5p, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-15a-5p, hsa-miR-15b-5p, hsa-miR-497-5p ve hsa-miR-424-5p’nin mir-15/16 ailesinin, hsa-miR-30c-5p, hsa-miR-30b-5p, hsa-miR-30a-5p’nin ise mir-30 ailesinin üyeleri olduğu ortaya çıkarıldı. Bu miRNA’ların potansiyel hedef genlerinin arasında hücre döngüsü başta olmak üzere, DNA hasarı, apoptoz, spermatogenez ve viral cevapla ilgili olan ABL2, BCL2, PLEKHA1, WNK3, CCNT2, DICER1, CCND1, CCND2, CCND3 ve WEE1 genlerinin olduğu gösterildi. Sonuç: Bu çalışma SARS-CoV-2 enfeksiyonu ile beraber testis dokusuna özgü miRNA’ların ve potansiyel hedef genlerinin ifadesinin değişebileceğini göstermektedir, böylece SARS-CoV-2 enfeksiyonunun erkeklerde testis üzerine etkisini moleküler olarak açıklamaya yardımcı olabilir.